Center for Bioinformatics &
Genome Biology

Students from the CBGB gave presentations at  the XXXI Congreso Sociedad de Microbiología de Chile. Santa Cruz, Chile 1-4 diciembre, 2009 (www.somich.cl). Claudia Lefimil won first place in the section of student oral presentations for her talk “Control of expression of the master iron regulator Fur in Acidithiobacillus ferrooxidans”. Jorge Valdes gave the following talk as part of his incorporation into the Sociedad de Microbiología de Chile: “Evolución genómica, diversidad metabólica y de regulación en el genero Acidithiobacillus: un abordaje genómico-comparativo para comprender la vida a pH 1”. David Holmes gave an invited talk in the round table “Extremófilos” entitled “Challenges for life at pH 1: terrestrial evolution and extra-terrestrial life signatures”.  

The following students presented posters:

• Amir Shmaryahu. Predicción computacional y validación experimental de RNA regulatorios pequeños en la bacteria acidofílica Acidithiobacillus ferrooxidans.
• Lilly Acuña. El regulador transcripcional Fur de Acidithiobacillus ferrooxidans une un centro [4Fe-4S].
• Roddy Jorquera. Base de Datos de Genes sin Intrones.
• Francisco Ossandón F. J. AlterORF: base de datos para descubrimiento de genes y depuración de genomas de microorganismos.
• Francisco Duarte. Una base de datos de proteínas en ambientes acídicos (DPAE).
• Hector Osorio. Predicción de genes y vías metabólicas para la obtención de energía en condiciones de anaerobiosis en la bacteria Acidithiobacillus ferrooxidans.
• Juan Pablo Cárdenas. Genómica comparativa de bacterias autótrofas facultativas y obligadas: diferencias clave para la regulación del ciclo de Calvin y otros aspectos de la autotrofía.